柴油機排煙系統處于手動模式時，可以通過人機交互界面對電動閥、進排風機和水泵單獨控制，完成控制系統調試，同時還可以進行排煙管路控制和能量回收器結冰清除。在手動模式下除電動閥單獨控制外，還可通過換熱器強制切換功能，同時控制所有的電動閥進行能量回收器切換。
通過溫度傳感器反饋排煙溫度與進風溫度的差值，控制變頻器的輸出，調節進排風和流量、冷卻水流量，保證排煙口溫度與環境溫差不超過設定值。PID控制器不需要精確的控制系統數學模型，具有較強的靈活性和適應性，可以采用各種PID控制的變種和改進的控制方式。
對于控制系統的變頻器，采用PI控制就可以達到預期的效果，PI控制的最大優點是減小系統的穩態誤差。在S7－200中，PID控制算法通常是通過調用PID向導生成的子程序實現的。PI控制時，將PID向導中微分時間設置為0，以降低排煙溫度為例。
PLC通過傳感器實時采集排煙溫度和進風溫度，計算出二者的實際差值并與系統設定值比較，計算出系統的控制偏差。PLC執行PID控制指令，調節進風流量，使排煙溫度降低，實際溫差減小，從而實現電站排煙溫度的連續控制。
